Faraday Protocol est un jeu de réflexion à la première personne qui mettra votre intelligence et votre esprit critique à l'épreuve. Vous êtes Raug Zeekon : archéologue interstellaire de la planète Cunor. Vous avez été envoyé par votre société pour enquêter sur la source d'un mystérieux signal provenant d'une étoile inexplorée.

Le Bia-Tool, une ancienne relique d'une civilisation extraterrestre, est le premier mystère que vous découvrez en arrivant sur OPIS. Incertain de sa véritable utilité, vous commencez à le manier pour résoudre les problèmes qui se présentent sur votre chemin. Grâce à sa capacité à absorber l'énergie et à la possibilité de la redistribuer vers différentes machines, vous commencez à vous enfoncer de plus en plus profondément dans les temples, rencontrant des énigmes encore plus difficiles qui mettront à l'épreuve votre intelligence et vos capacités à résoudre les problèmes. Êtes-vous suffisamment intelligent pour résoudre tous les défis qui se présentent à vous ?

Vous rencontrez une mystérieuse voix robotique. Son nom est IRIS, une I.A. créée pour garder les anciennes structures d'OPIS. Le complexe semble avoir été abandonné depuis des lustres, mais quel était son but ? Des salles remplies d'énigmes de plus en plus sophistiquées et complexes à mesure que vous progressez. Qui les a construites ? Pourquoi quelqu'un construirait-il un tel centre d'entraînement sur une planète par ailleurs abandonnée ?